La LPO met en oeuvre 10 des 16 plans nationaux de restauration d’oiseaux parmi les plus menacés de France (balbuzard pêcheur, butor étoilé, faucon crécerellette, gypaète barbu, milan royal, outarde canepetière, râle des genêts, vautour moine, vautour percnoptère).
Elle coordonne des programmes européens (Life Nature) de sauvegarde d’espèces...

Avec son réseau de délégations, la LPO est l’un des principaux conservatoires nationaux d’espaces naturels.
Elle gère près de 20 000 hectares de milieux naturels dont près de 15 000 ha en réserves naturelles terrestres et maritimes (notamment celle des Sept-Iles dans les Côtes d’Armor et celle de Lilleau des Niges sur l’île de Ré), et plus de 1 300 ha en propriété. Ces espaces sont principalement des zones humides dont la LPO est un des gestionnaires historiques majeurs.

La Mission juridique lutte contre les atteintes à la protection des oiseaux et à leurs habitats naturels, et contre les excès de la chasse. La LPO bénéficie de l’agrément "Protection de l’environnement", ce qui lui permet de porter plainte et de se constituer partie civile contre les infractions aux dispositions législatives relatives à la protection de la nature et de l’environnement (pollutions, atteintes à des milieux naturels et à des espèces...).

Acteur essentiel de l’éducation à l’environnement, la LPO bénéficie de l’agrément «Education nationale».
Elle propose à tous les publics, et plus particulièrement aux scolaires, des visites guidées, des conférences, des expositions... Ainsi, chaque année, plus de 3 500 animations ou programmes éducatifs sont proposés aux scolaires, soit près de 10 par jour.